O desenvolvimento da obra salesiana em Portugal foi bruscamente sufocado pelo golpe revolucionário de 1910, tal como aconteceu a outros institutos religiosos atingidos pelo Decreto-lei de 8 de Outubro.

Seguiu-se um período conturbado em que se assistiu à expulsão dos salesianos estrangeiros, assaltos às casas e intimidações de vária ordem. A situação só veio a regularizar-se a partir de 1920, ano em que reabriram as Oficinas de S. José de Lisboa. O Colégio de S. Caetano de Braga, o Orfanato João Baptista Machado de Angra, a Oficina de S. José de Viana e a Escola de Artes e Ofícios da Ilha de Moçambique não voltaram para as mãos dos salesianos.

Neste período da restauração e reinstalação da obra salesiana em Portugal, reabriram as Oficinas de S. José de Lisboa (1920) e a Oficina de S. José do Porto (1922). Esta última manteve-se sob a orientação salesiana até 1951. A seguir à reabertura das casas de Lisboa e do Porto, os salesianos fundaram ou assumiram a direção de outras obras com características idênticas às dos inícios.
Assim, em 1924, os salesianos entram no Seminário do Sagrado Coração de Jesus em Poiares da Régua; em 1926, fundam o Oratório de S. José de Évora; em 1927, a pedido de D. José da Costa Nunes, Bispo de Macau, vão para Díli (Timor Leste) para orientar uma Escola de Artes e Ofícios; em 1932 abrem o Asilo de Santo António do Estoril, e em 1938 o Instituto Salesiano de Mogofores e assumem a direção da Escola Agrícola de Semide (Miranda do Corvo).

Desde os primórdios até meados do séc. XX os salesianos de Portugal canalizaram quase todas as suas energias para as escolas de artes e ofícios, além da atenção dada aos centros juvenis. Tiveram sempre a preocupação de que o ensino teórico das artes e ofícios fosse acompanhado de forma equilibrada com a correspondente prática oficinal.

A partir da década de 1960 o ensino técnico tradicional começa a sentir uma acentuada queda nos países mais industrializados. Daí até ao seu desaparecimento não passaram muitos anos. Algumas escolas salesianas sofreram então uma mudança profunda: os espaços das antigas oficinas e internatos foram transformados em salas de aula, aumentou significativamente o número de alunos, verificou-se a participação de grande número de leigos na ação educativa.

A vertente profissionalizante continuou, apesar de tudo, no centro educativo de Vila do Conde (de onde os salesianos saíram em 2005), nos Salesianos do Porto (antigo Colégio dos Órfãos do Porto), em S. Vicente (Cabo Verde), em Moçambique (dependente da Província Portuguesa até 2006, hoje Visitadoria de Maria Auxiliadora de Moçambique), e no Colégio Salesiano de Poiares da Régua (até ao seu encerramento em 2018).

Hoje os salesianos em Portugal repartem a sua atividade por escolas, paróquias, um lar para crianças e jovens, centros juvenis, Comunicação Social e Missões.